Om du vill ha det mesta inom gångavstånd och gillar lite liv och rörelse så är såklart innerstaden ett bra val.
Om du hellre vill bo där det är lite lugnare och ha nära till naturen (och då kan tänka dig ett boende utanför tullarna), så skulle jag nog rekommendera Hammarbyhöjden/Björkhagen. Där har du bra kommunikationer - tunnelbanan tar bara några minuter in till Söder (som du nämnde), men ändå är det lugnt och Nackareservatet når du inom några minuters promenad.
Om du skriver lite mer om vad du vill bo i för typ av område (alltså vad du gillar/ogillar), så kanske jag kan komma med fler förslag