Finns egentligen inte så mycket på en högtalare som kan gå sönder. Jag skulle tippa på att det är nån form av störning eller glapp, nåt du kan fixa själv.
Smällen när du startar datorn är inget konstigt, den beror på de transienter som bildas när elektroniken på ljudkortet strömsätts. Inget du kan göra något åt, och inget att oroa sig för. Det är i sin ordning.
Ljudkort är generellt sett ganska känsliga för interferens i form av elektriska fält och sådant. Om det är ett "löst" kort som sitter på en av PCI-portarna i datorn kan du testa att sätta det i en annan port och se om det hjälper mot puttrandet. Det kan vara andra komponenter i datorn som stör.
Annars tycker jag du ska testa att rycka alla kablar mellan ljudkort och högtalare. Kan vara en så enkel pryl som lite glappkontakt nånstans.