Att allt inte går att ändra med ett enda klick beror på att allt är moduliserat, till skillnad från hur det är på Windows.
T ex en default installation av Ubuntu kör Xorg för att driva grafiken, Metacity för fönsterhantering (fönsterramar och deras betende) och GTK för widgets (knappar och "innehållet" i fönsterna). Dessutom är dina toolbars egna separata program. Antalet fönsterhanterade du kan välja på ligger nog runt 100-talet, vissa mer populära än andra (metacity, emerald, enlightenment, xfce) och alla använder olika temasystem eftersom dom har helt olika funktionalitet.
Förstår dock inte det svåra i att dra till gnome-look.org, ladda ner gtk och metacity teman, drag-droppa dom på temahanteraren för att autoinstallera dom och sedan bara välja den kombination av knapp+fönster tema som du vill använda. Även ikoner kan du drag-droppa på temahanteraren för att installera dom.
Compiz Fusion är inte en temahanterare, det Compiz Fusion gör är att lägga ett OpenGL lager med pluginstöd mellan Xorg och fönsterhanteraren (metacity, emerald osv). Så CF är inte heller lösningen på temaproblemet du beskriver
Dessutom finns det ju kubuntu som kör med KDE istället för Gnome, och då har har du helt plötsligt ett annat widgetsystem och en annan fönsterhanterare.
Själv kör jag Ubuntu med Xorg, Compiz och Emerald :-)