Dina AGM-batterier är förmodligen på 100Ah, alltså amperetimmar. De bör kunna leverera bra mycket mer än 100A, ampere.
Men batterierna kommer inte att dra mer ström under laddning än vad generatorn kan leverera. Och att frånskiljarreläet är klassat för 100A betyder att det är testat med 100A belastning vid X-antal tillslag, borde inte vara några större problem att belasta en aning mer.
Jag kan varmt rekommendera att du läser igenom Skyllermarks Elguiden på följande länk för att lära dig mer om 12VDC elsystem.
https://sutars.com/elguiden/