På tal om att konvertera så brukar jag använda Handbrake (
http://www.handbrake.fr/) för att konvertera grejer.
Om din iPad är jailbreakad kan du installera VLC från cydia så äter den de flesta filformaten. Jailbreak kräver i sin tur att du kör 6.0-6.1.2 om du har iOS 6.