Nettoladdning hos peptider

Hur beräknar man nettoladdningen hos olika peptider vid olika pH-värden? Typ pH 3, pH 8 och 11.

Ex peptiden:

Glu-his-trp-ser-gly-leu-arg-pro-gly

Du får kolla vilka grupper som finns i sidokedjorna hos de ingående aminosyrorna. Kolla efter grupper som kan tänka sig protoneras eller deprotoneras. Vid till exempel högt pH ger glutamin gärna ifrån sig en proton och blir då minusladdad. Glycins sidokedja vägrar däremot vare sig ge ifrån sig en proton eller ta emot en, den är alltså neutral.

Glöm heller inte att peptiden i slutet på kedjan på en sida har en aminogrupp och på andra en karboxylsyra!