Ta bort Windows filen

hej FB!
Har sökt runt lite på nätet om hur man blir av med sin Windows fil på hårddisken.
Har två hårddiskar på datorn och har installerat Windows 7 på båda men kör endast det från ena hårddisken och använder den andra som en extra. Ungefär som en extern. men hur tar jag bort Windows filen från hårddisken?
Måste jag starta upp datorn den via den hårddisken och avinstallera Windows 7?
eller finns det något enklare sätt? ;D

Tack på förhand!

ev kan detta program hjälpa http://neosmart.net/dl.php?id=1

längre ner på sidan finns en gratis version

mvh
t