Internet Explorer får hemsidor att gråta och ta självmord, det är därför flash inte fungerar.
Skämt åsido - Som en workaround kan du ju alltid aktivera HMTL5-stöd i Youtube (
http://www.youtube.com/html5). Vet inte om IE stödjer html5, men det kan du ju testa om du vill.
Men för en bättre lösning på problemet råder jag dig att fly IE som pesten, och använda en bättre browser (tex chrome, firefox eller opera).