Om det går så måste du längre ner i datorn än bara mjukvara. Mjukvaran i windows laddas inte förrän datorn är startad. Formaterar du datorn direkt från en skiva hinner ditt skydd aldrig aktiveras och blir ditt skydd helt onödigt.
Jag tror faktiskt inte det finns någon riktigt smidig lösning på det du vill ha. Det du kan göra är att se till att ha backup på dina filer istället

En extern hårddisk eller liknande, sen är problemet löst.