Tror tyvärr inte det... Tror att det bland annat kommer att bli samma effekt som när du försöker formatera hårddisken i Windows (hårddisken med ditt OS på) medan du använder den. Installationen kommer att vilja ta bort/skriva över filer som Windows använder, och du kommer få felmeddelande. Därför kan installation/formatering bara ske när du inte använder disken i fråga, tex vid boot från skiva.
EDIT: Sorry om det där var lite flummigt...