Gimp men också Krita (som visserligen är ett konstprogram men som har en massa sjukt bra grejer för fotoredigering). Sumopaint är en online variant med som du kan kolla på.
Jag använder tidigare nämnda Gimp (mer funktioner, krångligare gränssnitt) och Krita (enkelt att använda) samt ett program som heter RawTherapee för att justera nivåer på RAW-filer.