Vinnaren i pepparkakshustävlingen!
2006-07-04, 21:49
  #1
Medlem
Omnigrås avatar

Stjärnor som samlar och skapar tyngre ämnen. Sprider dem...


Är DNA-molekylen den största och mest komplexa i naturen?
Citera
2006-07-05, 02:41
  #2
Medlem
woofers avatar
Nu är ju inte DNA en molekyl som ser ut på ett visst sätt utan består av 4 molekyler som kallas adenin, guanin, cytosin och tymin. Dessa sammanfogas i olika kombinationer för att bilda en DNA kedja. Alltså DNA är inte en specifik molekyl utan en typ av molekyl som kan variera i längd.

Edit: Vad gäller komplexiteten så beror det ju på hur man definierar det hela. DNA är någorlunda överskådligt i sin konstruktion och relativt lätt att förstå hur molekylen hänger ihop och hur man manipulerar den. Men med tanke på att en DNA-sträng pga av sin längd kan innehålla väldigt mycket information så får man väl ändå anse att dom kan höra till dom mer komplexa molekylerna. Annars finns det många proteiner som har en sammansättning som är betydligt svårare att förstå.
Citera
2006-07-05, 08:33
  #3
Medlem
Cardiacs avatar
Protein är betydligt mer komplexa än DNA. I DNA har du 4 nukleotider att välja mellan, i ett protein har du 20 olika aminosyror att välja mellan. Det är med dagens forskning inte möjligt att gå direkt från DNA-sekvens till proteinstruktur eller funktion (förutsatt att man inte vet proteinfamiljen då)
Citera
2006-07-05, 10:51
  #4
Medlem
Realizts avatar
Citat:
Ursprungligen postat av Cardiac
Protein är betydligt mer komplexa än DNA. I DNA har du 4 nukleotider att välja mellan, i ett protein har du 20 olika aminosyror att välja mellan.
Det finns en lång rad mindre vanliga varianter av aminosyrorna också.

Citat:
Det är med dagens forskning inte möjligt att gå direkt från DNA-sekvens till proteinstruktur eller funktion (förutsatt att man inte vet proteinfamiljen då)
Jaså verkligen? Givet en DNA-sekvens, kan man inte lista ut vilket protein den skulle korrespondera mot? I några fall vet man förstås det.
Citera
2006-07-05, 12:57
  #5
Medlem
Cardiacs avatar
Citat:
Ursprungligen postat av Realizt
Det finns en lång rad mindre vanliga varianter av aminosyrorna också.

Sant, ingen av dem är så vanlig dock.


Citat:
Ursprungligen postat av Realizt
Jaså verkligen? Givet en DNA-sekvens, kan man inte lista ut vilket protein den skulle korrespondera mot? I några fall vet man förstås det.

Givet en DNA-sekvens går det att lista ut hur en struktur ser ut, förutsatt att man kan identifiera proteinfamiljen från redan tidigare bestämda strukturer. Kan man inte detta är det med dagens teknik extremt svårt att få fram strukturen från DNA. Man kan få ut sekundärstrukturen, men det intressanta är 3D-strukturen.
Citera
2006-07-05, 15:29
  #6
Medlem
rvindebros avatar
Citat:
Ursprungligen postat av Cardiac
Sant, ingen av dem är så vanlig dock.




Givet en DNA-sekvens går det att lista ut hur en struktur ser ut, förutsatt att man kan identifiera proteinfamiljen från redan tidigare bestämda strukturer. Kan man inte detta är det med dagens teknik extremt svårt att få fram strukturen från DNA. Man kan få ut sekundärstrukturen, men det intressanta är 3D-strukturen.
man kan få ut primär strukturen (ordningen av aminosyror) men inte sekundärstrukturen (a-helixar, B-pleated sheats osv)

man vet alltså vilket protein det blir om man vet dna sekensen men man vet inget om hur den veckar sig eller vilken funtion den har bara från koden..
Citera
2006-07-05, 15:31
  #7
Medlem
rvindebros avatar
Citat:
Ursprungligen postat av Omnigrå

Stjärnor som samlar och skapar tyngre ämnen. Sprider dem...


Är DNA-molekylen den största och mest komplexa i naturen?
DNA är den största molekylen i naturen ja men vad menar du med komplex?
Citera
2006-07-05, 15:50
  #8
Medlem
Cardiacs avatar
Citat:
Ursprungligen postat av rvindebro
man kan få ut primär strukturen (ordningen av aminosyror) men inte sekundärstrukturen (a-helixar, B-pleated sheats osv)

man vet alltså vilket protein det blir om man vet dna sekensen men man vet inget om hur den veckar sig eller vilken funtion den har bara från koden..

ähmm, Jo, det kan man...
Eftersom man har löst strukturen på ca 10 000 proteiner tillhörande ca 500 familjer (gamla siffror visserligen men men...), vet man väldigt mycket statistik angående vad sekundärstrukturen består av.
Det finns index över vilka aminosyror som bildar alfa-helixar och b-sheet. Experiment har också visat vilka aminosyror som har större chans att bilda alfa-helixar. Använder du något bioinformatikprogram kan du få en väldigt bra prognos vilken sekundärstruktur du har på ditt protein givet sekvensen.
Sekundärstrukturen ger dock inte tertiärstrukturen, dvs det intressanta och det som definerar ett protein.
Eftersom väldigt många proteiner är kända, kan man genom att jämföra kodningen av DNA-sekvensen se vilka andra proteiner som är lika och om funktionen är känd på dessa lika proteiner kan man dra slutsatser om funktionen.

EDIT: Även om det inte är en enskild molekyl, skulle jag säga ribosomkomplexet som mest komplexa molekyl. Den gör något till skillnad från DNA.
Citera
2006-07-06, 14:56
  #9
Medlem
rvindebros avatar
Citat:
Ursprungligen postat av Cardiac
ähmm, Jo, det kan man...
Eftersom man har löst strukturen på ca 10 000 proteiner tillhörande ca 500 familjer (gamla siffror visserligen men men...), vet man väldigt mycket statistik angående vad sekundärstrukturen består av.
Det finns index över vilka aminosyror som bildar alfa-helixar och b-sheet. Experiment har också visat vilka aminosyror som har större chans att bilda alfa-helixar. Använder du något bioinformatikprogram kan du få en väldigt bra prognos vilken sekundärstruktur du har på ditt protein givet sekvensen.
Sekundärstrukturen ger dock inte tertiärstrukturen, dvs det intressanta och det som definerar ett protein.
Eftersom väldigt många proteiner är kända, kan man genom att jämföra kodningen av DNA-sekvensen se vilka andra proteiner som är lika och om funktionen är känd på dessa lika proteiner kan man dra slutsatser om funktionen.

EDIT: Även om det inte är en enskild molekyl, skulle jag säga ribosomkomplexet som mest komplexa molekyl. Den gör något till skillnad från DNA.
och vad man får fram är bara prediktioner på hur man TROR att den ser ut...
Citera
2006-07-06, 18:42
  #10
Medlem
Cardiacs avatar
Citat:
Ursprungligen postat av rvindebro
och vad man får fram är bara prediktioner på hur man TROR att den ser ut...

Som kommer stämma bra, givet det jag sa i mitt inlägg.
Förstår inte riktigt vad du menar, om du menar 3D-strukturen eller sekundärstrukturen eller något som jag missuppfattade?
Citera

Stöd Flashback

Flashback finansieras genom donationer från våra medlemmar och besökare. Det är med hjälp av dig vi kan fortsätta erbjuda en fri samhällsdebatt. Tack för ditt stöd!

Stöd Flashback