2021-02-15, 11:42
  #449833
Medlem
Bertil.Enstorings avatar
Citat:
Ursprungligen postat av Madagascar
Skåne rapporterar 699 nya fall. Förra måndagen rapporterade de 877 nya fall.

(Källa Reg Skåne och Platz)

Känns verkligen som en fortsatt stabil nedgång.
Dryga 2800 fall förra veckan mot 3400 veckan innan..
Citera
2021-02-15, 11:43
  #449834
Medlem
MrArturs avatar
Citat:
Ursprungligen postat av aw
Jag ska här visa genmodifieringsmarkörerna i CoV2-genomet från Wuhan. Vem som helst kan verifiera detta själv.

För att genmodifiera CoV2 har man använt två stycken enzym, som kallas EcoR1 respektive BstEII. Det är enzym från bakterier som klipper av RNA när de påträffar markörerna GAATTC respektive GTTACC. Det är standardmetoder inom genmodifiering. EcoR1 använder exempelvis enzym från koliebakterier (därav namnet Eco = E. coli).

https://en.wikipedia.org/wiki/EcoRI

Just de här metoderna klipper dels av RNA, men genererar också vad som kallas för "Sticky ends". Det används vid kloning och annan genmodifiering, när man vill byta ut en gensekvens mot en annan:

https://en.wikipedia.org/wiki/Sticky_and_blunt_ends

I CoV2-RNA från Wuhan kan vi mycket riktigt hitta markörerna GAATTC och GTTACC. De ligger exakt före och efter en kort snutt på 200 tecken. Som av en ren slump är det exakt denna lilla snutt som bestämmer vilken art (vilken ACE2) som viruset ska binda till. Den här snutten på cirka 200 tecken kallas för RBM (Receptor Binding Motif) och är en del av Spike-proteinet.

Här är en länk till det RNA man isolerade i Wuhan:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/MN908947

RBM ligger mellan 22892 och 23072. Det ser ut så här:

Kod:
    22861 tatagcttgg aattctaaca atcttgattc taaggttggt ggtaattata attacctgta
    22921 tagattgttt aggaagtcta atctcaaacc ttttgagaga gatatttcaa ctgaaatcta
    22981 tcaggccggt agcacacctt gtaatggtgt tgaaggtttt aattgttact ttcctttaca
    23041 atcatatggt ttccaaccca ctaatggtgt tggttaccaa ccatacagag tagtagtact
    23101 ttcttttgaa cttctacatg caccagcaac tgtttgtgga cctaaaaagt ctactaattt

Som ni kan se själva från min rödmarkering ligger markören GAATTC precis där RBM börjar, och markören GTTACC precis där RBM slutar.

Inget annat coronavirus har de här markörerna, enbart CoV2.

Om någon vill ha källa för att RBM ligger mellan 22892 och 23072 så går jag igenom det i de här två inläggen:

(FB) Corona kom från ett labb i Wuhan?
(FB) Corona kom från ett labb i Wuhan?
Så, din grund för detta är, förutsatt att det är riktigt, att det finns ett restriktionsenzym för två sekvenser i RBM?
Citera
2021-02-15, 11:47
  #449835
Medlem
MrArturs avatar
Citat:
Ursprungligen postat av aw
Det kan vara tecken på genmodifiering, men det kan också vara en ren slump. Om man utgår från att RNA är helt slumpmässigt, så är det 1 på 4096 sannolikhet att man får GAATTC av en slump. Så det är inte någon omöjlighet i sig.
Det finns bl.a ett naturligt urval som begränsar antalet rimliga kombinationer. I synnerhet för spikproteinet.
Citat:

Det som är graverande här är att det är två stycken markörer, som ligger på exakt rätt address i viruset.
Fast hade det varit en annan sekvens hade det ju bara varit att välja ett annat restriktionsenzym.

Av nyfikenhet. Vilken ligas användes för att klippa in det på rätt plats? "Sticky endings" är inte så relevant för enkelsidigt (single stranded) RNA.
__________________
Senast redigerad av MrArtur 2021-02-15 kl. 11:51.
Citera
2021-02-15, 11:51
  #449836
Medlem
Citat:
Ursprungligen postat av MrArtur
Så, din grund för detta är, förutsatt att det är riktigt, att det finns ett restriktionsenzym för två sekvenser i RBM?
Ja, eller rättare sagt att det finns två markörer för restriktionsenzym som flankerar RBM.
Citat:
Ursprungligen postat av severustheemperor
Had du sett någon analys där man försöker uttyda virusets skadefårmåga,
baserat på dess genkod? Eller är det fortfarande science fiction?
(Har letat men inte funnit något)
Nä, men det är inte heller troligt att man vet hur farligt viruset är, eller varför. En sån här genmodifiering är bara första steget för att smitta människoceller eller transgena labbmöss. Därifrån får viruset evolvera okontrollerat, med spontana mutationer.

Så forskarna styr inte hur viruset utvecklas, och vet inte hur farligt det blir. Det är en okontrollerad process, där man undersöker viruset efterhand och försöker klura ut vart det tagit vägen, och varför.
Citera
2021-02-15, 11:58
  #449837
Medlem
Citat:
Ursprungligen postat av Madagascar
Skåne rapporterar 699 nya fall. Förra måndagen rapporterade de 877 nya fall.

(Källa Reg Skåne och Platz)
Det är verkligen en enormt hög smittspridning i Sverige fortfarande, hoppas att vaccinationerna kan rullas ut fort så att så många liv som möjligt kan räddas.

Hong Kong har ungefär samma befolkning som Sverige i runda tal (ett par miljoner mindre), och här hade vi 4 nya fall på en dag. Inte dödsfall, utan fall, dvs. patienter som har fått positivt PCR-test.

Den här pandemin går att hantera med obligatoriska munskydd/andningsskydd, testande med omfattande smittspårning och karrantän för inresande.
Citera
2021-02-15, 11:59
  #449838
Medlem
MrArturs avatar
Citat:
Ursprungligen postat av aw
Ja, eller rättare sagt att det finns två markörer för restriktionsenzym som flankerar RBM.

Det finns ju också restriktionsenzym för i princip alla sekvenser mellan de som flankerar RBM. Är de också manipulerade?
Citera
2021-02-15, 12:00
  #449839
Medlem
Citat:
Ursprungligen postat av MrArtur
Det finns bl.a ett naturligt urval som begränsar antalet rimliga kombinationer. I synnerhet för spikproteinet.

Fast hade det varit en annan sekvens hade det ju bara varit att välja ett annat restriktionsenzym.

Av nyfikenhet. Vilken ligas användes för att klippa in det på rätt plats? "Sticky endings" är inte så relevant för enkelsidigt (single stranded) RNA.
Dina frågor är lite för tekniska för att jag ska kunna besvara dem, men här är en peer-reviewed artikel som påpekar samma sak, i mer diplomatiska ordalag:

https://link.springer.com/article/10.1007/s40142-020-00197-5
Finally, it has been speculated that the S protein of SARS-CoV-2 may have been manipulated. The successful engineered swapping of the S receptor-binding motif (RBM) of SARS-CoV, a region of S that is critical for ACE2 recognition, with several closely related bat coronaviruses in 2008, allowed modification of the S protein to interact with the ACE2 entry receptor [33]. Interestingly, the SARS-CoV-2 S ORF contains two unique restriction sites EcoRI (gaattc) and BstEII (ggttacc) flanking the RBM sequence that are not present in other human CoVs (HKU1, OC43, MERS, SARS-CoV) and could facilitate such engineering. It is striking that the RaTG13 S ORF contains the identical EcoRI and BstEII restriction sites. However, the full SARS-CoV-2 genome sequence contains 9 EcoRI and 4 BstEII sites, rendering these not unique.
Man har alltså gjort identiska experiment redan 2008, där man swappade RBM för SARS-liknande virus för att se om de kunde bli människoburna, vilket de blev.

RaTG13 är ju ett genom som Wuhan släppte efter coronapandemin började, och det spekuleras i att det är en dimridå.

Jag skrev förresten fel. Det är GGTTACC (7 tecken) för BstEII. Jag markerade ett tecken för lite.
Citera
2021-02-15, 12:09
  #449840
Medlem
Malins barn föll ihop på skolgården – utreds för långtidscovid
UPPDATERAD IDAG 09:59PUBLICERAD IDAG 06:00
Malins barn blev sjuka i mars 2020. Men när återkommande förkylningssymptom, bortdomnade ben och andningssvårigheter inte gav med sig, sökte de till sist vård. Nu utreds barnen för långtidscovid på Astrid Lindgrens specialistmottagning för barn.

– Vi hoppas att läkarna lyssnar på oss som levt med det här i 10 månaders tid, säger Malin.

I videon hör du Malin berätta om förkylningen som aldrig riktigt försvann.

https://www.svt.se/nyheter/lokalt/stockholm/malins-barn-foll-ihop-pa-skolgarden-utreds-for-langtidscovid

Så om båda barnen drabbas.. då måste det ju betyda väldigt otur eller nån farligare variant.
Bort domningar i ben, andningsvårigheter och sjuk i tio månaders tid...här förnekare har ni eran "vanliga förkylning".
__________________
Senast redigerad av hagelskur 2021-02-15 kl. 12:26.
Citera
2021-02-15, 12:10
  #449841
Medlem
Citat:
Ursprungligen postat av MrArtur
Det finns ju också restriktionsenzym för i princip alla sekvenser mellan de som flankerar RBM. Är de också manipulerade?
Det är mer än jag känner till, men man får också försöka fundera på vad som är rimligt. Att man kan hitta något obskyrt enzym som passar några tecken i mitten är inte samma sak som att hitta världens vanligaste (?) restriktionsenzym exakt där RBM börjar.

Som du såg i artikeln jag skickade är det ju inte bara jag som påpekar detta otroliga sammanträffande:

https://link.springer.com/article/10.1007/s40142-020-00197-5
Citera
2021-02-15, 12:14
  #449842
Medlem
MrArturs avatar
Citat:
Ursprungligen postat av aw
Dina frågor är lite för tekniska för att jag ska kunna besvara dem, men här är en peer-reviewed artikel som påpekar samma sak, i mer diplomatiska ordalag:

https://link.springer.com/article/10.1007/s40142-020-00197-5
Finally, it has been speculated that the S protein of SARS-CoV-2 may have been manipulated. The successful engineered swapping of the S receptor-binding motif (RBM) of SARS-CoV, a region of S that is critical for ACE2 recognition, with several closely related bat coronaviruses in 2008, allowed modification of the S protein to interact with the ACE2 entry receptor [33]. Interestingly, the SARS-CoV-2 S ORF contains two unique restriction sites EcoRI (gaattc) and BstEII (ggttacc) flanking the RBM sequence that are not present in other human CoVs (HKU1, OC43, MERS, SARS-CoV) and could facilitate such engineering. It is striking that the RaTG13 S ORF contains the identical EcoRI and BstEII restriction sites. However, the full SARS-CoV-2 genome sequence contains 9 EcoRI and 4 BstEII sites, rendering these not unique.
Man har alltså gjort identiska experiment redan 2008, där man swappade RBM för SARS-liknande virus för att se om de kunde bli människoburna, vilket de blev.

Och argumenterar sedan genom Andersen et al. att naturligt urval är mer sannolikt. Alltså, att det finns sekvenser som vi vet att selektiva restriktionsenzymer klipper vid är ett väldigt ospecifikt stöd. I synnerhet när denna apofeni selekterar efter sekvens. Det finns tusentals restriktionsenzym som klipper även längre sekvenser. Det säger ingenting. Crispr/cas9 hade också kunnat användas. Det hela är extremt ospecifikt och väldigt stora (och förmodligen säkra) slutsatser på väldigt ospecifikt underlag.
Citat:

RaTG13 är ju ett genom som Wuhan släppte efter coronapandemin började, och det spekuleras i att det är en dimridå.

Det är klart det gör. Det spekuleras om att jorden är platt också.
Citat:

Jag skrev förresten fel. Det är GGTTACC (7 tecken) för BstEII. Jag markerade ett tecken för lite.
Din markering var lite fel, men du skrev rätt, så den var enkel att hitta.
Citera
2021-02-15, 12:16
  #449843
Medlem
MrArturs avatar
Citat:
Ursprungligen postat av aw
Det är mer än jag känner till, men man får också försöka fundera på vad som är rimligt. Att man kan hitta något obskyrt enzym som passar några tecken i mitten är inte samma sak som att hitta världens vanligaste (?) restriktionsenzym exakt där RBM börjar.

Det jag ville visa vara att du kan hitta enzym som klipper i princip varje sekvens du vill påstå är inklippt. Och vill man som biologisk ingenjör undvika upptäckt vore det betydligt smartare att inte ta världens vanligaste. Vissa menar också att den är en korsning med HIV.
Citat:

Som du såg i artikeln jag skickade är det ju inte bara jag som påpekar detta otroliga sammanträffande:

https://link.springer.com/article/10.1007/s40142-020-00197-5
Jag har sett den. De drar inte alla samma slutsatser som du gör.
__________________
Senast redigerad av MrArtur 2021-02-15 kl. 12:18.
Citera
2021-02-15, 12:22
  #449844
Medlem
Citat:
Ursprungligen postat av arbetet
Så här i backspegeln har inte världen hanterat smittan särskilt bra. Vi ska vara glada över att SCoV2 trots allt inte är det riktiga killer-viruset. I framtiden kanske vi inte har lika stor tur och då gäller det verkligen att världen kan samarbeta. Om mänskligheten ska överleva.

Det gäller verkligen att man släpper konspirationsteorier och lämnar sådana till där de hör hemma. Utanför vetenskapen. Det leder bara till slutenhet hur mycket man än försöker vara öppna. Och öppenhet är en förutsättning för att vi ska lyckas. Här kritiserar jag även den kinesiska regimen som hade kunnat vara mer öppna initialt. Men det är långt ifrån att ge dem skulden för pandemin vare sig det handlar om olycka eller inte.
Om jag jämför Sverige och Hong Kong så tycks det vara så att myndigheterna i Hong Kong ansåg det vara värt att försöka stoppa spridningen, medan myndigheterna i Sverige antagligen landade i slutsatsen att viruset inte var dödligt nog för att ta till åtgärder som att begränsa inresande, sätta folk i karrantän osv "det här är inte det riktiga killer-viruset".

I Hong Kong har det sedan 19e mars varit obligatoriskt med 2 veckors karrantän för alla som anländer från utlandet.
Citera

Skapa ett konto eller logga in för att kommentera

Du måste vara medlem för att kunna kommentera

Skapa ett konto

Det är enkelt att registrera ett nytt konto

Bli medlem

Logga in

Har du redan ett konto? Logga in här

Logga in