Jag förstår ärligt talat inte vad du menar med din fråga...
https://en.wikipedia.org/wiki/X_Window_System är typ en display manager / window system som brukar ligga som bas i Linux-system. Det ser ut som Windows 3.1, med högre upplösningen, fast ändå fulare.
Det är typ det absolut mest minimala grafiska gränssnitt du kan föreställa dig. Jag har inte sett det på åratal, men vill minnas det dök upp ibland när man pajade sina grafikdrivrutiner när man pillade runt med Ubuntu runt 2006. Ovanpå Xorg körs olika
andra gränssnitt som Gnome, KDE, Fluxbox eller vad som helst. Vissa program specialutvecklas för att fungera specifikt med Gnome eller KDE.
Börja med en "vanlig" Linuxdistro, typ Ubuntu, Mint, eller vad som helst egentligen. Då får du typ ett färdigt system med t e x
https://sv.wikipedia.org/wiki/GNOME som skrivbordsmiljö (alternativ till GNOME är typ
https://sv.wikipedia.org/wiki/KDE), finns även andra). Börja med att lära dig terminalen (som i själva verket är ett program som heter BASH). Härifrån kan du lära dig använda olika terminalprogram, och därifrån kommer du bland annat få bättre förståelse för hur olika saker funkar och varför olika paket installeras.
När du t ex installerar ett program med "apt get" i terminalen kommer du få se en lista på ytterligare paket/program som måste installeras för att ditt önskade program ska funka.
Grovt hugget kan du se det hela som att avancerade program drar nytta av funktioner ur olika kodbibliotek, och dessa bibliotek måste installeras för att programmen ö h t ska funka. Anledningen till att du bör lära dig gör allt detta via terminalen är att du kommer få se exakt vad som händer, emedan t e x nyare versionerna av ubuntu "döljer" denna information pr default eftersom scrollande terminaltext gör folk lite nervösa.
Jag vet inte ens om det är detta du undrar över ... vad specifikt försöker du åstadkomma? Jobba på din FreeBSD burk och spara filerna på din Windows-dator?