Om du har läst alla kurser på samma universitet så söker du i alla fall på det totala antalet poäng. Jag skulle tro att det fungerar så även om du har läst dom andra kurserna vid ett annat universitet.
edit: Hittade denna länk:
http://www.lu.se/utbildning/anmaelan-och-antagning/urval
"I urvalsgruppen akademiska poäng ger all statlig och kommunal högskole-/universitetsutbildning på grundnivå och avancerad nivå, som avklarats vid ansökningstidens utgång, akademiska poäng."
Så det verkar alltså vara så att det är det totala antalet poäng som räknas, oavsett om kurserna har lästs på olika universitet.