Jag körde först en scan på C: utan att scanna boot sector, det fungerade felfritt. Efter det så körde jag bara på E:, F:, G: och vid 82.2% så stannade den och ansåg att jag skulle scanna systempartitionen som nyligen var scannad.
Testade att uppdatera igen, vilket inte servrarna tyckte (= var nere).
När jag väl lyckades uppdatera så körde jag alla diskar igen (först med boot sector med samma resultat som tidigare), sen skippade jag boot sector och trots att jag scannat C: så fastnar den när den scannat resten av hårddiskarna vid 82.2% med detta meddelande "You are recommended to perform a scan of the system partition. Start this now?"
Klickar jag "No" så blir det 100% färdigt, och inget mer händer.
Klickade återigen på "Complete scan" och den fastnar vid "Scanning the registry" 42 scanned files, 95.5% finished.
Edit: Det är en gammal hdd som sitter som sekundär hårddisk, den innehåller en del av den gamla windowskatalogen. Det var inga problem förut men det kanske har med saken att göra?
Master boot records är väl alltid samma boot sector (dvs C

?