Dödligt virus från Kina orsakar panik (SARS-CoV-2, COVID-19)

Så länge det är relativt lite smitta av en mutation så kommer den initialt att spridas i kluster. Det var därför man trodde på klusterutbrott under hösten också, man trodde att man skulle kunna hålla nere smittan. Så initialt så kommer man exempelvis på en mindre ort att få många fall av det muterade viruset, medan det på en grannort inte kommer att finnas några fall. Detta gör att slumpmässiga tester vid relativt få sekvenserade (jag är väl medveten om att det heter/stavas så) fall kommer att riskera att visa alldeles för hög eller för låg incidens.

Sedan kan man ju välja att inte sekvensera slumpmässigt heller, man kan ju välja att ta fallen från områden där man tycker att spridningen är mycket snabbt ökande. Då kommer man få större sannolikhet att hitta mutationerna, men samtidigt så har man ingen aning om hur utbredda de är totalt sett.

Har man inte kontroll på gruppen man mäter så behöver man så många fler tester...

Ja, det är anmärkningsvärt. Även R-talet tycks öka igen.

https://renkulab.shinyapps.io/COVID-19-Epidemic-Forecasting/_w_3ad97a78/_w_f3735ace/_w_712f2611/?tab=jhu_pred&country=Sweden

Jag hänger inte med riktigt vad du menar med screeningen ovan. Men borde man inte kunna säga att eftersom ca 1 % av de positiva fallen gensekvensernas, så kan man ta antalet upptäckta fall utan resekoppling multiplicerat med 100 och därmed få hur många fall av den engelska varianten man har, fast med samma mörkertal som den ordinarie smittan?

Det skulle innebära att man med nuvarande 5 upptäckta fall har cirka 500 verkliga fall av engelska varianten, ej medräknat mörkertalet som ger en ännu större siffra (baserat på skattningar om ca 50 % mörkertal jag sett bör det vara drygt 1000 verkliga fall av engelska varianten totalt sett).

För att få till en procentsats behöver man veta under hur lång tid dessa 500 fall uppstått och dela 500 med de totalt bekräftade fallen under samma period. Här blir det för min del en gissning då jag inte vet. Men om vi häftar med 6000 bekräftade fall per dag gånger 7 dagar = 42000 fall per vecka, och vi antar att de 500 också var under en vecka, så ger det 500/42000=1,2% av fallen under tidsperioden.

Första delen, 500 fall eller cirka 1000 med mörkertal, känns ganska robust. Andra delen med vad man ska sätta i nämnaren känns desto osäkrare.

Så bra sagt. Det är också därför man får så låg efterföljning för vissa, eftersom reglerna är så krångliga tar människor gärna den lätta vägen.
Jag har antikroppar, jag är ung, jag har ingen i riskgrupp i min familj, jag ska bara, jag behöver det här osv osv.

Det är också mer krångligt än ovan, det är lokala regionala regler och vissa regioner har vissa regler, rektorerna får sitta med riskanalyser om de ska stänga skolorna och sen ringa smittskyddsläkaren för att få stänga skolorna. Det är så trögt förvaltningssystem och så kringelkrångel kring reglerna.

Jag har läst denna tråd sen mars lite mindre under sommaren, men har ändå inte koll på alla regler. Jag rör mig inte ute så mycket affären apoteket och munskydd på i alla situationer som är inomhus förutom i mitt hem. Ändå har jag inte koll på alla regler som ligger till grund för vårt smittskyddsarbete.

När man för diagram över ECDC:s smittade per 100 000 så ser det ut som smittan äntligen är på avtagande.
Från vecka 43 tom. vecka 52 går kurvan lodrätt uppåt men sedan pekar kurvan rätt så bra nedåt.

Nota bene; ECDC:s siffror har en veckas fördröjning.

Notera att jag i mitt exempel inte pratar om incidens i hela befolkningen utan om andelen av varianten i de PCR-prover som tas.

Nej, vad gäller skolorna känner jag ingen större osäkerhet. Det är glasklart att om man drar ned på fysiska kontakter och sociala interaktioner så minskar smittan. Det är verkligen ingen fråga att diskutera huruvida det är på det viset. Det är liksom självklart.

Vilket klimat viruset trivs bäst i däremot tycker jag spretar en del. Alpmiljö med torr luft och kyligt verkar viruset gilla. Men det tycks även gilla det fuktiga klimatet i London, eller subtropiska kimatet i New Delhi. I Arizona är det torrt och varmt, men i New York har ju också smittan spridits duktigt, liksom i LA. Inte riktigt samma klimat på de platserna. Spridningen i storstäderna kan ju förklaras av att det är svårare att hålla fysisk distans. Mardrömmen hade kanske varit en storstad i alpmiljö?

Men den säger ingenting (mer än att det finns fall) om man inte vet vad det är för prover man testat och om man inte testat tillräckligt. Jag skulle gissa att man sekvenserar där man misstänker att mutationen finns (resande från Storbritannien och Sydafrika), samt en del slumpmässiga. Om man har sekvenserat under 100 prover på tre veckor i början av december och man säger att man inte har kapacitet för så mycket mer så kan man nog inte säga mycket alls om förekomsten annat än att de muterade virusen med 501Y finns ute i samhället redan. Man har knappast haft möjlighet att sekvensera så många fler prover under en vecka (v53) än vad man gjorde under tre veckor i början av december om man har kapacitetsbrist. Eller har man lyckats skala upp denna så mycket redan? Finns det några siffror på detta?

Hur många nya döda tror du FHM vågar släppa idag? Kommer man fortsätta hålla inne på dödstalen och publicera bara 200-300 idag med?

https://sverigesradio.se/artikel/7642118

60 frakturer på en dag (gårdagen) i lilla Mölndal! Ortopederna säger åt folk att använda broddar. Men SANDAR inte kommunen i ett sådant här allvarligt läge..? Det känns som att den ena handen inte vet vad den andra gör.

Just dessa siffror karlkula och TAD2 förnekade i absurdum. De hade fel, återigen.

Följer Sverige CDC:s riktlinjer så bör nu samtliga skolor hållas stängda tills vi hamnar under 200 per 100 000.

Svårt att veta, men skulle tro det. Förhoppningsvis får vi en tillfällig lättnad snart i och med jullovet. Kanske börjar den märkas nästa vecka, eller veckan därefter. De som dör idag, blev ju i allmänhet smittade för cirka 3 veckor sedan. Allt sker ju med eftersläpning.