Dualismen inom buddhism (zen kontra traditionell)

Till er som är insatta, det verkar finnas två olika synsätt inom buddhismen.
Jag har alltid trott buddhismen ser själen och kroppen som enade och något gemensamt, men inom Zen verkar det vara en dogm att det är separerade och ett av de främsta målen är att "frigöra" sig själv från "kötthuset" och där vikten ligger i kontroll, både över det fysiska och mentala. Inom traditionell buddhism tycker jag mig finna att söka harmoni.

Är det någon egentlig praktisk skillnad i synsätten? Målet verkar vara detsamma, att frigöra sig från passionerna.
Är det eventuellt samma sak, bara formulerat olika?