Om någon till äventyrs har samma problem som jag så är detta fixet:
För att åtgärda felet "Kan inte nå javascript körtid för anpassad användning" görs följande.
1. Hämta och köra filen "MicrosoftFixit50181.msi" från
http://go.microsoft.com/?linkid=9648765
2. Surfa till
https://install.bankid.com och gå igenom installationen på nytt (eller som jag gjorde, använd den du laddade hem när problemet uppstod).
3. När installationen är klar trycker du på knappen "Klicka här när du är klar med installationen" för att kontrollera att webbläsaren känner av programmet. Testa att starta om webbläsaren om det inte hittas.